Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBXN2AP68543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBXN2AP68543 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBXN2AP68543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBXN2AP68543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
UBXN2AP68543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN2AP68543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms