Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL39P62891 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL39P62891 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL39P62891 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P62891 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P62891 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL39P62891 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL39P62891 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P62891 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P62891 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P62891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P62891 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL39P62891 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL39P62891 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P62891 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P62891 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P62891 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL39P62891 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL39P62891 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL39P62891 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P62891 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P62891 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P62891 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL39P62891 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL39P62891 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL39P62891 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL39P62891 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P62891 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P62891 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P62891 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL39P62891 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL39P62891 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL39P62891 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL39P62891 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P62891 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL39P62891 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms