Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS25P62851 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS25P62851 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS25P62851 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS25P62851 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS25P62851 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS25P62851 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS25P62851 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS25P62851 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS25P62851 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS25P62851 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS25P62851 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS25P62851 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS25P62851 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS25P62851 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS25P62851 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS25P62851 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS25P62851 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS25P62851 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS25P62851 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS25P62851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS25P62851 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS25P62851 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS25P62851 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS25P62851 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS25P62851 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS25P62851 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS25P62851 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS25P62851 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS25P62851 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS25P62851 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS25P62851 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS25P62851 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS25P62851 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS25P62851 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS25P62851 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS25P62851 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS25P62851 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS25P62851 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS25P62851 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS25P62851 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS25P62851 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS25P62851 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS25P62851 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS25P62851 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS25P62851 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS25P62851 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS25P62851 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS25P62851 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS25P62851 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS25P62851 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS25P62851 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS25P62851 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS25P62851 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS25P62851 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS25P62851 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS25P62851 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS25P62851 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS25P62851 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS25P62851 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS25P62851 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS25P62851 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms