Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRP54P61011 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP54P61011 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRP54P61011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP54P61011 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP54P61011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP54P61011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRP54P61011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP54P61011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP54P61011 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP54P61011 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP54P61011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRP54P61011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP54P61011 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP54P61011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP54P61011 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRP54P61011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP54P61011 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP54P61011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP54P61011 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP54P61011 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP54P61011 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP54P61011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP54P61011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP54P61011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP54P61011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP54P61011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP54P61011 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP54P61011 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP54P61011 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP54P61011 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP54P61011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP54P61011 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP54P61011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP54P61011 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP54P61011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRP54P61011 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRP54P61011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SRP54P61011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRP54P61011 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRP54P61011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRP54P61011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP54P61011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP54P61011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP54P61011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP54P61011 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRP54P61011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRP54P61011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRP54P61011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP54P61011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP54P61011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP54P61011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP54P61011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRP54P61011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRP54P61011 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP54P61011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRP54P61011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRP54P61011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP54P61011 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP54P61011 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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