Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD23AP54725 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD23AP54725 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAD23AP54725 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAD23AP54725 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms