Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSEN2P49810 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN2P49810 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSEN2P49810 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN2P49810 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSEN2P49810 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms