Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRA4P48169 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRA4P48169 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABRA4P48169 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRA4P48169 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms