Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSKP41240 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSKP41240 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CSKP41240 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSKP41240 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSKP41240 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSKP41240 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSKP41240 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSKP41240 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSKP41240 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSKP41240 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSKP41240 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSKP41240 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSKP41240 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSKP41240 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSKP41240 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSKP41240 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSKP41240 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CSKP41240 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSKP41240 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSKP41240 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSKP41240 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSKP41240 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSKP41240 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSKP41240 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSKP41240 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSKP41240 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSKP41240 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSKP41240 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSKP41240 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSKP41240 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSKP41240 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSKP41240 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSKP41240 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSKP41240 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSKP41240 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSKP41240 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSKP41240 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CSKP41240 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSKP41240 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSKP41240 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSKP41240 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSKP41240 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSKP41240 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSKP41240 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSKP41240 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSKP41240 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSKP41240 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSKP41240 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSKP41240 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSKP41240 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSKP41240 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSKP41240 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSKP41240 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSKP41240 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSKP41240 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSKP41240 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSKP41240 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSKP41240 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSKP41240 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSKP41240 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSKP41240 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSKP41240 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms