Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC5P40937 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFC5P40937 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFC5P40937 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFC5P40937 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFC5P40937 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFC5P40937 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFC5P40937 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFC5P40937 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RFC5P40937 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC5P40937 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFC5P40937 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFC5P40937 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFC5P40937 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFC5P40937 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFC5P40937 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFC5P40937 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFC5P40937 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFC5P40937 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC5P40937 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC5P40937 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC5P40937 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC5P40937 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC5P40937 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFC5P40937 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RFC5P40937 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC5P40937 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC5P40937 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC5P40937 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC5P40937 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC5P40937 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFC5P40937 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFC5P40937 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFC5P40937 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC5P40937 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC5P40937 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC5P40937 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC5P40937 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC5P40937 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC5P40937 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC5P40937 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC5P40937 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC5P40937 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC5P40937 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC5P40937 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC5P40937 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC5P40937 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC5P40937 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC5P40937 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC5P40937 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RFC5P40937 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFC5P40937 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC5P40937 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC5P40937 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC5P40937 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC5P40937 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFC5P40937 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFC5P40937 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC5P40937 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RFC5P40937 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms