Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH1P40692 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH1P40692 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH1P40692 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH1P40692 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH1P40692 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH1P40692 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH1P40692 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH1P40692 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH1P40692 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH1P40692 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH1P40692 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH1P40692 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH1P40692 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH1P40692 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH1P40692 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH1P40692 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH1P40692 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH1P40692 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH1P40692 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH1P40692 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MLH1P40692 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH1P40692 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH1P40692 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH1P40692 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MLH1P40692 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MLH1P40692 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MLH1P40692 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MLH1P40692 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MLH1P40692 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MLH1P40692 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MLH1P40692 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH1P40692 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MLH1P40692 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MLH1P40692 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MLH1P40692 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH1P40692 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MLH1P40692 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MLH1P40692 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MLH1P40692 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MLH1P40692 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MLH1P40692 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MLH1P40692 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH1P40692 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MLH1P40692 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH1P40692 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH1P40692 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH1P40692 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MLH1P40692 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH1P40692 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MLH1P40692 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH1P40692 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MLH1P40692 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH1P40692 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH1P40692 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH1P40692 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MLH1P40692 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH1P40692 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH1P40692 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MLH1P40692 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MLH1P40692 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH1P40692 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MLH1P40692 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH1P40692 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MLH1P40692 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH1P40692 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MLH1P40692 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH1P40692 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH1P40692 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH1P40692 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH1P40692 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MLH1P40692 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH1P40692 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH1P40692 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH1P40692 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH1P40692 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MLH1P40692 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH1P40692 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH1P40692 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH1P40692 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MLH1P40692 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH1P40692 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH1P40692 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH1P40692 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH1P40692 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MLH1P40692 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MLH1P40692 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms