Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GTF2E1P29083 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GTF2E1P29083 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GTF2E1P29083 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GTF2E1P29083 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GTF2E1P29083 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GTF2E1P29083 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms