Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCAP28676 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCAP28676 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCAP28676 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCAP28676 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCAP28676 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCAP28676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCAP28676 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCAP28676 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCAP28676 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCAP28676 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCAP28676 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCAP28676 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCAP28676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCAP28676 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCAP28676 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCAP28676 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCAP28676 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCAP28676 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCAP28676 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCAP28676 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCAP28676 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCAP28676 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCAP28676 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCAP28676 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCAP28676 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCAP28676 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCAP28676 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCAP28676 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCAP28676 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCAP28676 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCAP28676 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCAP28676 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCAP28676 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCAP28676 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCAP28676 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCAP28676 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCAP28676 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCAP28676 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCAP28676 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCAP28676 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCAP28676 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCAP28676 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCAP28676 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCAP28676 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCAP28676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCAP28676 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCAP28676 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCAP28676 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCAP28676 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCAP28676 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCAP28676 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCAP28676 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCAP28676 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCAP28676 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCAP28676 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCAP28676 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCAP28676 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCAP28676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCAP28676 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCAP28676 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCAP28676 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCAP28676 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCAP28676 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCAP28676 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCAP28676 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCAP28676 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCAP28676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCAP28676 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCAP28676 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCAP28676 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GCAP28676 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCAP28676 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCAP28676 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCAP28676 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCAP28676 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCAP28676 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCAP28676 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCAP28676 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCAP28676 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCAP28676 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCAP28676 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms