Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRMP19623 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRMP19623 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRMP19623 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRMP19623 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRMP19623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRMP19623 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRMP19623 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRMP19623 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRMP19623 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRMP19623 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRMP19623 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRMP19623 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRMP19623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRMP19623 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRMP19623 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRMP19623 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRMP19623 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRMP19623 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRMP19623 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRMP19623 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMP19623 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRMP19623 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMP19623 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRMP19623 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMP19623 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMP19623 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRMP19623 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMP19623 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMP19623 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMP19623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMP19623 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRMP19623 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRMP19623 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRMP19623 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRMP19623 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMP19623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMP19623 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMP19623 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRMP19623 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRMP19623 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRMP19623 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMP19623 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMP19623 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMP19623 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMP19623 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRMP19623 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMP19623 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMP19623 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMP19623 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRMP19623 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRMP19623 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRMP19623 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRMP19623 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRMP19623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRMP19623 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRMP19623 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRMP19623 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRMP19623 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRMP19623 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRMP19623 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRMP19623 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRMP19623 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRMP19623 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRMP19623 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRMP19623 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRMP19623 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRMP19623 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRMP19623 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRMP19623 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRMP19623 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRMP19623 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRMP19623 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRMP19623 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms