Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXB4P17483 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB4P17483 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB4P17483 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB4P17483 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB4P17483 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB4P17483 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB4P17483 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB4P17483 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB4P17483 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB4P17483 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB4P17483 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB4P17483 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB4P17483 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB4P17483 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB4P17483 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB4P17483 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB4P17483 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB4P17483 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB4P17483 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB4P17483 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms