Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP4P12644 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP4P12644 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP4P12644 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP4P12644 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP4P12644 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMP4P12644 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP4P12644 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP4P12644 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP4P12644 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMP4P12644 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP4P12644 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP4P12644 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMP4P12644 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMP4P12644 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMP4P12644 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP4P12644 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP4P12644 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMP4P12644 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP4P12644 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP4P12644 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMP4P12644 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP4P12644 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP4P12644 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP4P12644 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMP4P12644 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP4P12644 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP4P12644 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMP4P12644 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMP4P12644 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP4P12644 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP4P12644 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP4P12644 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP4P12644 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP4P12644 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP4P12644 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP4P12644 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP4P12644 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP4P12644 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP4P12644 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP4P12644 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP4P12644 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP4P12644 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP4P12644 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP4P12644 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP4P12644 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP4P12644 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP4P12644 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP4P12644 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP4P12644 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP4P12644 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP4P12644 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP4P12644 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP4P12644 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP4P12644 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP4P12644 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms