Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LCTP09848 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LCTP09848 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LCTP09848 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LCTP09848 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCTP09848 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCTP09848 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCTP09848 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCTP09848 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LCTP09848 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCTP09848 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCTP09848 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCTP09848 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCTP09848 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LCTP09848 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCTP09848 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LCTP09848 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCTP09848 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LCTP09848 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LCTP09848 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LCTP09848 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCTP09848 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCTP09848 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCTP09848 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCTP09848 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LCTP09848 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LCTP09848 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LCTP09848 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LCTP09848 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LCTP09848 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LCTP09848 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LCTP09848 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LCTP09848 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LCTP09848 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCTP09848 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCTP09848 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LCTP09848 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCTP09848 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCTP09848 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LCTP09848 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCTP09848 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LCTP09848 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCTP09848 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LCTP09848 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LCTP09848 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LCTP09848 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LCTP09848 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LCTP09848 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LCTP09848 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LCTP09848 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LCTP09848 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCTP09848 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCTP09848 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCTP09848 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCTP09848 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LCTP09848 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LCTP09848 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LCTP09848 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LCTP09848 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LCTP09848 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LCTP09848 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LCTP09848 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCTP09848 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCTP09848 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LCTP09848 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCTP09848 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LCTP09848 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LCTP09848 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCTP09848 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCTP09848 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LCTP09848 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms