Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP3P08254 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP3P08254 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP3P08254 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP3P08254 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP3P08254 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP3P08254 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MMP3P08254 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP3P08254 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP3P08254 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP3P08254 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP3P08254 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MMP3P08254 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP3P08254 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP3P08254 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP3P08254 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP3P08254 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MMP3P08254 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMP3P08254 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP3P08254 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP3P08254 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP3P08254 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP3P08254 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MMP3P08254 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP3P08254 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP3P08254 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP3P08254 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP3P08254 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP3P08254 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP3P08254 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP3P08254 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP3P08254 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP3P08254 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP3P08254 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP3P08254 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP3P08254 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP3P08254 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP3P08254 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP3P08254 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP3P08254 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP3P08254 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP3P08254 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP3P08254 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP3P08254 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP3P08254 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP3P08254 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP3P08254 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP3P08254 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP3P08254 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP3P08254 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP3P08254 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP3P08254 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP3P08254 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP3P08254 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP3P08254 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP3P08254 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP3P08254 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP3P08254 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP3P08254 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP3P08254 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP3P08254 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP3P08254 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MMP3P08254 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MMP3P08254 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MMP3P08254 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP3P08254 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP3P08254 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP3P08254 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MMP3P08254 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MMP3P08254 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP3P08254 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MMP3P08254 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP3P08254 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP3P08254 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MMP3P08254 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP3P08254 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MMP3P08254 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP3P08254 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP3P08254 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP3P08254 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MMP3P08254 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP3P08254 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP3P08254 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms