Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSP90AB1P08238 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HSP90AB1P08238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
HSP90AB1P08238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSP90AB1P08238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
HSP90AB1P08238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms