Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN2P04844 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN2P04844 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN2P04844 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN2P04844 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN2P04844 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN2P04844 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN2P04844 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN2P04844 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN2P04844 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN2P04844 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN2P04844 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN2P04844 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN2P04844 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN2P04844 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN2P04844 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN2P04844 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN2P04844 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN2P04844 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN2P04844 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN2P04844 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN2P04844 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN2P04844 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN2P04844 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN2P04844 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN2P04844 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN2P04844 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN2P04844 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN2P04844 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN2P04844 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN2P04844 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN2P04844 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN2P04844 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN2P04844 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN2P04844 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN2P04844 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN2P04844 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN2P04844 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN2P04844 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN2P04844 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPN2P04844 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPN2P04844 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPN2P04844 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPN2P04844 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPN2P04844 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPN2P04844 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPN2P04844 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPN2P04844 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPN2P04844 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPN2P04844 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPN2P04844 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPN2P04844 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPN2P04844 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPN2P04844 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPN2P04844 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPN2P04844 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPN2P04844 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPN2P04844 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPN2P04844 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPN2P04844 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPN2P04844 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPN2P04844 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPN2P04844 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms