Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9P02748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9P02748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9P02748 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9P02748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9P02748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9P02748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9P02748 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9P02748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9P02748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9P02748 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9P02748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9P02748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9P02748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9P02748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9P02748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9P02748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9P02748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9P02748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9P02748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P02748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P02748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P02748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P02748 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9P02748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9P02748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9P02748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
C9P02748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9P02748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P02748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P02748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9P02748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9P02748 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9P02748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C9P02748 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P02748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P02748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P02748 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P02748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C9P02748 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C9P02748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9P02748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9P02748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C9P02748 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P02748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P02748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P02748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P02748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C9P02748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9P02748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9P02748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C9P02748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms