Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB3O75712 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB3O75712 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB3O75712 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB3O75712 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB3O75712 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB3O75712 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB3O75712 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB3O75712 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB3O75712 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB3O75712 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB3O75712 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB3O75712 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB3O75712 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB3O75712 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB3O75712 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB3O75712 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB3O75712 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB3O75712 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB3O75712 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB3O75712 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB3O75712 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB3O75712 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB3O75712 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB3O75712 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB3O75712 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB3O75712 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB3O75712 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB3O75712 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB3O75712 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB3O75712 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB3O75712 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB3O75712 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB3O75712 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB3O75712 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB3O75712 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB3O75712 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB3O75712 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB3O75712 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJB3O75712 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB3O75712 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB3O75712 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB3O75712 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB3O75712 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB3O75712 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB3O75712 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB3O75712 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB3O75712 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB3O75712 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB3O75712 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB3O75712 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB3O75712 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB3O75712 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB3O75712 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB3O75712 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB3O75712 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB3O75712 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB3O75712 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB3O75712 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB3O75712 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB3O75712 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB3O75712 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB3O75712 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB3O75712 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB3O75712 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB3O75712 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB3O75712 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB3O75712 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB3O75712 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB3O75712 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB3O75712 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB3O75712 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJB3O75712 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB3O75712 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB3O75712 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB3O75712 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB3O75712 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB3O75712 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB3O75712 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms