Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KATNA1O75449 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KATNA1O75449 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KATNA1O75449 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KATNA1O75449 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KATNA1O75449 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms