Protein–RNA interactions for Protein: O60895

RAMP2, Receptor activity-modifying protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAMP2O60895 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAMP2O60895 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAMP2O60895 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAMP2O60895 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAMP2O60895 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAMP2O60895 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAMP2O60895 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms