Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3O43617 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3O43617 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3O43617 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3O43617 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms