Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGFBR3LH3BV60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGFBR3LH3BV60 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGFBR3LH3BV60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TGFBR3LH3BV60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TGFBR3LH3BV60 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms