Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA5E9PKD4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA5E9PKD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA5E9PKD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA5E9PKD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA5E9PKD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms