Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BHMG1C9JSJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BHMG1C9JSJ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BHMG1C9JSJ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BHMG1C9JSJ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BHMG1C9JSJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BHMG1C9JSJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms