Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMTNL1A8MU46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMTNL1A8MU46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMTNL1A8MU46 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNL1A8MU46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNL1A8MU46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms