Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.06■□□□□ 0.969e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.929e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.759e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-215ENST00000588702 622 ntTSL 219.72■□□□□ 0.752e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 319.6■□□□□ 0.739e-9■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 419.36■□□□□ 0.699e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.699e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 319.32■□□□□ 0.682e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-207ENST00000585608 848 ntTSL 318.86■□□□□ 0.612e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.69e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.589e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.559e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 218.49■□□□□ 0.552e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 318.3■□□□□ 0.529e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.59e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.489e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 517.86■□□□□ 0.452e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.419e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.399e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 217.37■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.359e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-206ENST00000585460 680 ntTSL 216.9■□□□□ 0.32e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ZNF500-207ENST00000591026 2397 nt16.05■□□□□ 0.169e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-205ENST00000585427 557 ntTSL 415.06■□□□□ 02e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.129e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-220ENST00000592194 556 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-218ENST00000589309 407 ntTSL 313.65□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 AC020663.1-201ENST00000588099 556 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.579e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.63□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.292e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.6□□□□□ -1.359e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 ZNF500-205ENST00000588942 276 ntTSL 35.71□□□□□ -1.59e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.53□□□□□ -29e-7■□□□□ 8.5
SLTMQ9NWH9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.195e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.155e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 KLHDC4-225ENST00000569487 2072 ntTSL 220.1■□□□□ 0.815e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.775e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.715e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -05e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.214e-11■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 ICAM5-203ENST00000586480 2599 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 14e-11■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 425.86■■□□□ 1.735e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.735e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.45e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.26■□□□□ 0.195e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.68□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.52e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 524.16■■□□□ 1.462e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 522.73■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 322.73■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 222.65■■□□□ 1.222e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 422.49■■□□□ 1.192e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 319.9■□□□□ 0.782e-6■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-12■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-12■□□□□ 8.4
SLTMQ9NWH9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.752e-8■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.312e-8■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.238e-15■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 SPN-203ENST00000436527 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.598e-15■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.843e-7■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 TACC3-206ENST00000470136 650 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.18□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 56.92□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.3
SLTMQ9NWH9 ZNF580-204ENST00000590190 335 ntTSL 319.92■□□□□ 0.782e-10■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 319.81■□□□□ 0.762e-10■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-10■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-204ENST00000427389 571 ntTSL 425.82■■□□□ 1.722e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-206ENST00000462610 525 ntTSL 424.39■■□□□ 1.492e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-209ENST00000493939 480 ntTSL 424.34■■□□□ 1.492e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-208ENST00000490169 505 ntTSL 420.87■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-202ENST00000412832 529 ntTSL 519.99■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-205ENST00000456626 843 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 517.03■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 515.44■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 JOSD1-203ENST00000417712 623 ntTSL 414.74□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 8.2
SLTMQ9NWH9 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 514.24□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.2
Retrieved 100 of 8,230 protein–RNA pairs in 51.7 ms