RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526820.5

GNPTG-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 572 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-202ENST00000526820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
GNPTG-202ENST00000526820 ABCC9O60706 1549 aa43.32■■■■■ 4.53
GNPTG-202ENST00000526820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.13■■■■■ 4.49
GNPTG-202ENST00000526820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.14■■■■■ 4.18
GNPTG-202ENST00000526820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
GNPTG-202ENST00000526820 NACADO15069 1562 aa40.75■■■■■ 4.11
GNPTG-202ENST00000526820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.46■■■■■ 4.07
GNPTG-202ENST00000526820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.39■■■■■ 4.06
GNPTG-202ENST00000526820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
GNPTG-202ENST00000526820 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.15■■■■■ 4.02
GNPTG-202ENST00000526820 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.01■■■■□ 3.99
GNPTG-202ENST00000526820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
GNPTG-202ENST00000526820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.71■■■■□ 3.95
GNPTG-202ENST00000526820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.41■■■■□ 3.9
GNPTG-202ENST00000526820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.2■■■■□ 3.87
GNPTG-202ENST00000526820 SCRIBQ14160 1630 aa39.19■■■■□ 3.86
GNPTG-202ENST00000526820 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.07■■■■□ 3.85
GNPTG-202ENST00000526820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
GNPTG-202ENST00000526820 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.84■■■■□ 3.65
GNPTG-202ENST00000526820 NCAPD3P42695 1498 aa37.57■■■■□ 3.6
GNPTG-202ENST00000526820 CUX2O14529 1486 aa37.54■■■■□ 3.6
GNPTG-202ENST00000526820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.45■■■■□ 3.59
GNPTG-202ENST00000526820 ERCC6Q03468 1493 aa37.41■■■■□ 3.58
GNPTG-202ENST00000526820 SMARCA4P51532 1647 aa37.4■■■■□ 3.58
GNPTG-202ENST00000526820 HMGXB3Q12766 1538 aa37.35■■■■□ 3.57
GNPTG-202ENST00000526820 SMARCA2P51531 1590 aa37.32■■■■□ 3.56
GNPTG-202ENST00000526820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
GNPTG-202ENST00000526820 NESP48681 1621 aa37.14■■■■□ 3.54
GNPTG-202ENST00000526820 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.08■■■■□ 3.53
GNPTG-202ENST00000526820 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.06■■■■□ 3.52
GNPTG-202ENST00000526820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
GNPTG-202ENST00000526820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
GNPTG-202ENST00000526820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.86■■■■□ 3.49
GNPTG-202ENST00000526820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.78■■■■□ 3.48
GNPTG-202ENST00000526820 WIZO95785 1651 aa36.57■■■■□ 3.44
GNPTG-202ENST00000526820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.54■■■■□ 3.44
GNPTG-202ENST00000526820 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.41■■■■□ 3.42
GNPTG-202ENST00000526820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
GNPTG-202ENST00000526820 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.33■■■■□ 3.41
GNPTG-202ENST00000526820 WDR62O43379 1518 aa36.31■■■■□ 3.4
GNPTG-202ENST00000526820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
GNPTG-202ENST00000526820 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.1■■■■□ 3.37
GNPTG-202ENST00000526820 CFTRP13569 1480 aa36.05■■■■□ 3.36
GNPTG-202ENST00000526820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36■■■■□ 3.35
GNPTG-202ENST00000526820 TRIM41Q8WV44 630 aa35.98■■■■□ 3.35
GNPTG-202ENST00000526820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
GNPTG-202ENST00000526820 PRDM2Q13029 1718 aa35.77■■■■□ 3.32
GNPTG-202ENST00000526820 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.77■■■■□ 3.32
GNPTG-202ENST00000526820 OSCARQ8IYS5 282 aa35.59■■■■□ 3.29
GNPTG-202ENST00000526820 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
GNPTG-202ENST00000526820 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
GNPTG-202ENST00000526820 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.41■■■■□ 3.26
GNPTG-202ENST00000526820 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
GNPTG-202ENST00000526820 IFT140Q96RY7 1462 aa35.37■■■■□ 3.25
GNPTG-202ENST00000526820 TOPBP1Q92547 1522 aa35.31■■■■□ 3.24
GNPTG-202ENST00000526820 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
GNPTG-202ENST00000526820 ARHGEF11O15085 1522 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTG-202ENST00000526820 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
GNPTG-202ENST00000526820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.18■■■■□ 3.22
GNPTG-202ENST00000526820 CHD1O14646 1710 aa35.12■■■■□ 3.21
GNPTG-202ENST00000526820 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
GNPTG-202ENST00000526820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
GNPTG-202ENST00000526820 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
GNPTG-202ENST00000526820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
GNPTG-202ENST00000526820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.86■■■■□ 3.17
GNPTG-202ENST00000526820 ARAP1Q96P48 1450 aa34.84■■■■□ 3.17
GNPTG-202ENST00000526820 SOGA1O94964 1423 aa34.81■■■■□ 3.16
GNPTG-202ENST00000526820 CUX1P39880 1505 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTG-202ENST00000526820 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.78■■■■□ 3.16
GNPTG-202ENST00000526820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.77■■■■□ 3.16
GNPTG-202ENST00000526820 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
GNPTG-202ENST00000526820 WDR97A6NE52 1622 aa34.72■■■■□ 3.15
GNPTG-202ENST00000526820 FBLN2P98095 1184 aa34.67■■■■□ 3.14
GNPTG-202ENST00000526820 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.65■■■■□ 3.14
GNPTG-202ENST00000526820 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.65■■■■□ 3.14
GNPTG-202ENST00000526820 SYNJ1O43426 1573 aa34.54■■■■□ 3.12
GNPTG-202ENST00000526820 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
GNPTG-202ENST00000526820 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
GNPTG-202ENST00000526820 PBRM1Q86U86 1689 aa34.48■■■■□ 3.11
GNPTG-202ENST00000526820 GRIN2BQ13224 1484 aa34.47■■■■□ 3.11
GNPTG-202ENST00000526820 SYNJ2O15056 1496 aa34.41■■■■□ 3.1
GNPTG-202ENST00000526820 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
GNPTG-202ENST00000526820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.4■■■■□ 3.1
GNPTG-202ENST00000526820 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
GNPTG-202ENST00000526820 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.31■■■■□ 3.08
GNPTG-202ENST00000526820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.089e-6■■■■■ 50.1
GNPTG-202ENST00000526820 TOP2BQ02880 1626 aa34.25■■■■□ 3.07
GNPTG-202ENST00000526820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
GNPTG-202ENST00000526820 ADAMTS12P58397 1594 aa34.07■■■■□ 3.05
GNPTG-202ENST00000526820 GRIN2AQ12879 1464 aa34.06■■■■□ 3.04
GNPTG-202ENST00000526820 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.06■■■■□ 3.04
GNPTG-202ENST00000526820 CEP170Q5SW79 1584 aa34.01■■■■□ 3.03
GNPTG-202ENST00000526820 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.96■■■■□ 3.03
GNPTG-202ENST00000526820 NUP160Q12769 1436 aa33.96■■■■□ 3.03
GNPTG-202ENST00000526820 SHROOM2Q13796 1616 aa33.95■■■■□ 3.03
GNPTG-202ENST00000526820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.94■■■■□ 3.02
GNPTG-202ENST00000526820 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
GNPTG-202ENST00000526820 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.76■■■□□ 2.99
GNPTG-202ENST00000526820 IGF1RP08069 1367 aa33.65■■■□□ 2.98
GNPTG-202ENST00000526820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.62■■■□□ 2.97
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