RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527168.5

GNPTG-205, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 5

Gene GNPTG, Length 1,317 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-205ENST00000527168 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.57■■■■■ 6.65
GNPTG-205ENST00000527168 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.24■■■■■ 5.63
GNPTG-205ENST00000527168 ABCC9O60706 1549 aa49.28■■■■■ 5.48
GNPTG-205ENST00000527168 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.34■■■■■ 5.17
GNPTG-205ENST00000527168 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.33■■■■■ 5.17
GNPTG-205ENST00000527168 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
GNPTG-205ENST00000527168 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
GNPTG-205ENST00000527168 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
GNPTG-205ENST00000527168 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.77■■■■■ 5.08
GNPTG-205ENST00000527168 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.24■■■■■ 4.99
GNPTG-205ENST00000527168 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.08■■■■■ 4.97
GNPTG-205ENST00000527168 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.93■■■■■ 4.94
GNPTG-205ENST00000527168 SCRIBQ14160 1630 aa45.9■■■■■ 4.94
GNPTG-205ENST00000527168 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.38■■■■■ 4.86
GNPTG-205ENST00000527168 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.3■■■■■ 4.84
GNPTG-205ENST00000527168 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
GNPTG-205ENST00000527168 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.54■■■■■ 4.72
GNPTG-205ENST00000527168 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.27■■■■■ 4.68
GNPTG-205ENST00000527168 SMARCA4P51532 1647 aa43.88■■■■■ 4.62
GNPTG-205ENST00000527168 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
GNPTG-205ENST00000527168 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.68■■■■■ 4.58
GNPTG-205ENST00000527168 NCAPD3P42695 1498 aa43.64■■■■■ 4.58
GNPTG-205ENST00000527168 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.61■■■■■ 4.57
GNPTG-205ENST00000527168 SMARCA2P51531 1590 aa43.59■■■■■ 4.57
GNPTG-205ENST00000527168 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.44■■■■■ 4.54
GNPTG-205ENST00000527168 HMGXB3Q12766 1538 aa43.4■■■■■ 4.54
GNPTG-205ENST00000527168 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
GNPTG-205ENST00000527168 WIZO95785 1651 aa43.12■■■■■ 4.49
GNPTG-205ENST00000527168 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
GNPTG-205ENST00000527168 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
GNPTG-205ENST00000527168 NESP48681 1621 aa42.64■■■■■ 4.42
GNPTG-205ENST00000527168 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.47■■■■■ 4.39
GNPTG-205ENST00000527168 ERCC6Q03468 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
GNPTG-205ENST00000527168 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.39■■■■■ 4.38
GNPTG-205ENST00000527168 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.21■■■■■ 4.35
GNPTG-205ENST00000527168 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.19■■■■■ 4.34
GNPTG-205ENST00000527168 CFTRP13569 1480 aa42.12■■■■■ 4.33
GNPTG-205ENST00000527168 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.08■■■■■ 4.33
GNPTG-205ENST00000527168 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GNPTG-205ENST00000527168 CUX2O14529 1486 aa41.99■■■■■ 4.31
GNPTG-205ENST00000527168 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
GNPTG-205ENST00000527168 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.9■■■■■ 4.3
GNPTG-205ENST00000527168 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.83■■■■■ 4.29
GNPTG-205ENST00000527168 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.79■■■■■ 4.28
GNPTG-205ENST00000527168 PRDM2Q13029 1718 aa41.71■■■■■ 4.27
GNPTG-205ENST00000527168 WDR62O43379 1518 aa41.63■■■■■ 4.26
GNPTG-205ENST00000527168 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
GNPTG-205ENST00000527168 TOPBP1Q92547 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
GNPTG-205ENST00000527168 ABCC8Q09428 1581 aa41.18■■■■■ 4.18
GNPTG-205ENST00000527168 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.15■■■■■ 4.18
GNPTG-205ENST00000527168 IFT140Q96RY7 1462 aa40.97■■■■■ 4.15
GNPTG-205ENST00000527168 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
GNPTG-205ENST00000527168 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
GNPTG-205ENST00000527168 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
GNPTG-205ENST00000527168 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.79■■■■■ 4.12
GNPTG-205ENST00000527168 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.77■■■■■ 4.12
GNPTG-205ENST00000527168 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.11
GNPTG-205ENST00000527168 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.72■■■■■ 4.11
GNPTG-205ENST00000527168 SOGA1O94964 1423 aa40.72■■■■■ 4.11
GNPTG-205ENST00000527168 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.19e-6■■■■■ 50.1
GNPTG-205ENST00000527168 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
GNPTG-205ENST00000527168 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
GNPTG-205ENST00000527168 SYNJ1O43426 1573 aa40.54■■■■■ 4.08
GNPTG-205ENST00000527168 TOP2BQ02880 1626 aa40.52■■■■■ 4.08
GNPTG-205ENST00000527168 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
GNPTG-205ENST00000527168 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
GNPTG-205ENST00000527168 WDR97A6NE52 1622 aa40.39■■■■■ 4.06
GNPTG-205ENST00000527168 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.37■■■■■ 4.05
GNPTG-205ENST00000527168 OSCARQ8IYS5 282 aa40.3■■■■■ 4.04
GNPTG-205ENST00000527168 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.23■■■■■ 4.03
GNPTG-205ENST00000527168 GRIN2BQ13224 1484 aa40.23■■■■■ 4.03
GNPTG-205ENST00000527168 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTG-205ENST00000527168 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.19■■■■■ 4.02
GNPTG-205ENST00000527168 FBLN2P98095 1184 aa40.13■■■■■ 4.01
GNPTG-205ENST00000527168 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
GNPTG-205ENST00000527168 PBRM1Q86U86 1689 aa40.1■■■■■ 4.01
GNPTG-205ENST00000527168 CHD1O14646 1710 aa40.09■■■■■ 4.01
GNPTG-205ENST00000527168 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
GNPTG-205ENST00000527168 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
GNPTG-205ENST00000527168 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
GNPTG-205ENST00000527168 ADAMTS12P58397 1594 aa39.81■■■■□ 3.96
GNPTG-205ENST00000527168 KIF27Q86VH2 1401 aa39.79■■■■□ 3.96
GNPTG-205ENST00000527168 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.77■■■■□ 3.96
GNPTG-205ENST00000527168 GRIN2AQ12879 1464 aa39.71■■■■□ 3.95
GNPTG-205ENST00000527168 TRIM41Q8WV44 630 aa39.68■■■■□ 3.94
GNPTG-205ENST00000527168 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.68■■■■□ 3.94
GNPTG-205ENST00000527168 IGF1RP08069 1367 aa39.66■■■■□ 3.94
GNPTG-205ENST00000527168 ARHGEF11O15085 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTG-205ENST00000527168 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTG-205ENST00000527168 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTG-205ENST00000527168 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTG-205ENST00000527168 NUP160Q12769 1436 aa39.54■■■■□ 3.92
GNPTG-205ENST00000527168 CEP170Q5SW79 1584 aa39.52■■■■□ 3.92
GNPTG-205ENST00000527168 CUL7Q14999 1698 aa39.48■■■■□ 3.91
GNPTG-205ENST00000527168 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.46■■■■□ 3.91
GNPTG-205ENST00000527168 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.41■■■■□ 3.9
GNPTG-205ENST00000527168 ARAP1Q96P48 1450 aa39.32■■■■□ 3.88
GNPTG-205ENST00000527168 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.3■■■■□ 3.88
GNPTG-205ENST00000527168 SHROOM2Q13796 1616 aa39.22■■■■□ 3.87
GNPTG-205ENST00000527168 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.21■■■■□ 3.87
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