RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588702.5

PRKAR1A-215, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-215ENST00000588702 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.83■■■■■ 4.77
PRKAR1A-215ENST00000588702 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.69■■■■□ 3.94
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC9O60706 1549 aa38.28■■■■□ 3.72
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
PRKAR1A-215ENST00000588702 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.34■■■■□ 3.57
PRKAR1A-215ENST00000588702 NACADO15069 1562 aa37.23■■■■□ 3.55
PRKAR1A-215ENST00000588702 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
PRKAR1A-215ENST00000588702 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.18■■■■□ 3.54
PRKAR1A-215ENST00000588702 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.14■■■■□ 3.54
PRKAR1A-215ENST00000588702 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.2■■■■□ 3.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 SCRIBQ14160 1630 aa36.14■■■■□ 3.38
PRKAR1A-215ENST00000588702 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.87■■■■□ 3.33
PRKAR1A-215ENST00000588702 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.71■■■■□ 3.31
PRKAR1A-215ENST00000588702 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
PRKAR1A-215ENST00000588702 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
PRKAR1A-215ENST00000588702 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.68■■■■□ 3.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 SMARCA4P51532 1647 aa34.66■■■■□ 3.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.66■■■■□ 3.14
PRKAR1A-215ENST00000588702 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.49■■■■□ 3.11
PRKAR1A-215ENST00000588702 SMARCA2P51531 1590 aa34.42■■■■□ 3.1
PRKAR1A-215ENST00000588702 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.37■■■■□ 3.09
PRKAR1A-215ENST00000588702 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.36■■■■□ 3.09
PRKAR1A-215ENST00000588702 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
PRKAR1A-215ENST00000588702 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
PRKAR1A-215ENST00000588702 HMGXB3Q12766 1538 aa34.18■■■■□ 3.06
PRKAR1A-215ENST00000588702 WIZO95785 1651 aa34.15■■■■□ 3.06
PRKAR1A-215ENST00000588702 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PRKAR1A-215ENST00000588702 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PRKAR1A-215ENST00000588702 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PRKAR1A-215ENST00000588702 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.47■■■□□ 2.95
PRKAR1A-215ENST00000588702 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.36■■■□□ 2.93
PRKAR1A-215ENST00000588702 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.36■■■□□ 2.93
PRKAR1A-215ENST00000588702 CFTRP13569 1480 aa33.24■■■□□ 2.91
PRKAR1A-215ENST00000588702 NESP48681 1621 aa33.22■■■□□ 2.91
PRKAR1A-215ENST00000588702 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.16■■■□□ 2.9
PRKAR1A-215ENST00000588702 ERCC6Q03468 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRDM2Q13029 1718 aa33.03■■■□□ 2.88
PRKAR1A-215ENST00000588702 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.93■■■□□ 2.86
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.88■■■□□ 2.85
PRKAR1A-215ENST00000588702 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.86■■■□□ 2.85
PRKAR1A-215ENST00000588702 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.7■■■□□ 2.83
PRKAR1A-215ENST00000588702 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCC8Q09428 1581 aa32.63■■■□□ 2.81
PRKAR1A-215ENST00000588702 WDR62O43379 1518 aa32.56■■■□□ 2.8
PRKAR1A-215ENST00000588702 CUX2O14529 1486 aa32.54■■■□□ 2.8
PRKAR1A-215ENST00000588702 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
PRKAR1A-215ENST00000588702 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.47■■■□□ 2.79
PRKAR1A-215ENST00000588702 TOPBP1Q92547 1522 aa32.45■■■□□ 2.78
PRKAR1A-215ENST00000588702 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.78
PRKAR1A-215ENST00000588702 CUX1P39880 1505 aa32.34■■■□□ 2.77
PRKAR1A-215ENST00000588702 TOP2BQ02880 1626 aa32.25■■■□□ 2.75
PRKAR1A-215ENST00000588702 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.23■■■□□ 2.75
PRKAR1A-215ENST00000588702 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
PRKAR1A-215ENST00000588702 SYNJ1O43426 1573 aa32.19■■■□□ 2.74
PRKAR1A-215ENST00000588702 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.18■■■□□ 2.74
PRKAR1A-215ENST00000588702 IFT140Q96RY7 1462 aa32.18■■■□□ 2.74
PRKAR1A-215ENST00000588702 SOGA1O94964 1423 aa32.15■■■□□ 2.74
PRKAR1A-215ENST00000588702 TRIM41Q8WV44 630 aa32.04■■■□□ 2.72
PRKAR1A-215ENST00000588702 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PRKAR1A-215ENST00000588702 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.02■■■□□ 2.72
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.94■■■□□ 2.7
PRKAR1A-215ENST00000588702 WDR97A6NE52 1622 aa31.93■■■□□ 2.7
PRKAR1A-215ENST00000588702 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.87■■■□□ 2.69
PRKAR1A-215ENST00000588702 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
PRKAR1A-215ENST00000588702 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.81■■■□□ 2.682e-11■■■■■ 45
PRKAR1A-215ENST00000588702 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PRKAR1A-215ENST00000588702 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.77■■■□□ 2.68
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF27Q86VH2 1401 aa31.73■■■□□ 2.67
PRKAR1A-215ENST00000588702 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.71■■■□□ 2.67
PRKAR1A-215ENST00000588702 GRIN2BQ13224 1484 aa31.7■■■□□ 2.66
PRKAR1A-215ENST00000588702 PBRM1Q86U86 1689 aa31.61■■■□□ 2.65
PRKAR1A-215ENST00000588702 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.59■■■□□ 2.65
PRKAR1A-215ENST00000588702 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PRKAR1A-215ENST00000588702 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.52■■■□□ 2.64
PRKAR1A-215ENST00000588702 IGF1RP08069 1367 aa31.49■■■□□ 2.63
PRKAR1A-215ENST00000588702 EEA1Q15075 1411 aa31.49■■■□□ 2.63
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
PRKAR1A-215ENST00000588702 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.43■■■□□ 2.62
PRKAR1A-215ENST00000588702 SYNJ2O15056 1496 aa31.43■■■□□ 2.62
PRKAR1A-215ENST00000588702 FBLN2P98095 1184 aa31.42■■■□□ 2.62
PRKAR1A-215ENST00000588702 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.42■■■□□ 2.62
PRKAR1A-215ENST00000588702 CUL7Q14999 1698 aa31.4■■■□□ 2.62
PRKAR1A-215ENST00000588702 ADAMTS12P58397 1594 aa31.37■■■□□ 2.61
PRKAR1A-215ENST00000588702 OSCARQ8IYS5 282 aa31.36■■■□□ 2.61
PRKAR1A-215ENST00000588702 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.35■■■□□ 2.61
PRKAR1A-215ENST00000588702 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.34■■■□□ 2.61
PRKAR1A-215ENST00000588702 CHD1O14646 1710 aa31.32■■■□□ 2.6
PRKAR1A-215ENST00000588702 GRIN2AQ12879 1464 aa31.26■■■□□ 2.59
PRKAR1A-215ENST00000588702 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
PRKAR1A-215ENST00000588702 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.21■■■□□ 2.59
PRKAR1A-215ENST00000588702 PRXQ9BXM0 1461 aa31.16■■■□□ 2.58
PRKAR1A-215ENST00000588702 NUP160Q12769 1436 aa31.09■■■□□ 2.57
PRKAR1A-215ENST00000588702 CEP170Q5SW79 1584 aa31.02■■■□□ 2.56
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIF21BO75037 1637 aa31.02■■■□□ 2.56
PRKAR1A-215ENST00000588702 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.98■■■□□ 2.55
PRKAR1A-215ENST00000588702 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.98■■■□□ 2.55
PRKAR1A-215ENST00000588702 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.97■■■□□ 2.55
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