RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.34	■■■■■ 6.45
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.6	■■■■■ 5.53
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCC9	O60706	1549 aa		49.58	■■■■■ 5.53
GNPTG-209	ENST00000534197	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.15	■■■■■ 5.14
GNPTG-209	ENST00000534197	NACAD	O15069	1562 aa		46.86	■■■■■ 5.09
GNPTG-209	ENST00000534197	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.66	■■■■■ 5.06
GNPTG-209	ENST00000534197	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.53	■■■■■ 5.04
GNPTG-209	ENST00000534197	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.26	■■■■■ 5
GNPTG-209	ENST00000534197	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.21	■■■■■ 4.99
GNPTG-209	ENST00000534197	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.19	■■■■■ 4.98
GNPTG-209	ENST00000534197	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.9	■■■■■ 4.94
GNPTG-209	ENST00000534197	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	45.89	■■■■■ 4.94
GNPTG-209	ENST00000534197	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.67	■■■■■ 4.9
GNPTG-209	ENST00000534197	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.26	■■■■■ 4.84
GNPTG-209	ENST00000534197	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.1	■■■■■ 4.81
GNPTG-209	ENST00000534197	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.8	■■■■■ 4.76
GNPTG-209	ENST00000534197	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.71	■■■■■ 4.75
GNPTG-209	ENST00000534197	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.62	■■■■■ 4.73
GNPTG-209	ENST00000534197	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.27	■■■■■ 4.52
GNPTG-209	ENST00000534197	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.19	■■■■■ 4.5
GNPTG-209	ENST00000534197	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GNPTG-209	ENST00000534197	SMARCA2	P51531	1590 aa		43	■■■■■ 4.47
GNPTG-209	ENST00000534197	HMGXB3	Q12766	1538 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GNPTG-209	ENST00000534197	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
GNPTG-209	ENST00000534197	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GNPTG-209	ENST00000534197	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
GNPTG-209	ENST00000534197	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GNPTG-209	ENST00000534197	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.69	■■■■■ 4.43
GNPTG-209	ENST00000534197	NES	P48681	1621 aa		42.66	■■■■■ 4.42
GNPTG-209	ENST00000534197	CUX2	O14529	1486 aa		42.61	■■■■■ 4.41
GNPTG-209	ENST00000534197	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GNPTG-209	ENST00000534197	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GNPTG-209	ENST00000534197	WIZ	O95785	1651 aa		42.22	■■■■■ 4.35
GNPTG-209	ENST00000534197	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
GNPTG-209	ENST00000534197	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GNPTG-209	ENST00000534197	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		41.98	■■■■■ 4.31
GNPTG-209	ENST00000534197	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.96	■■■■■ 4.31
GNPTG-209	ENST00000534197	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	41.81	■■■■■ 4.28
GNPTG-209	ENST00000534197	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GNPTG-209	ENST00000534197	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
GNPTG-209	ENST00000534197	WDR62	O43379	1518 aa		41.59	■■■■■ 4.25
GNPTG-209	ENST00000534197	CFTR	P13569	1480 aa		41.51	■■■■■ 4.24
GNPTG-209	ENST00000534197	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.5	■■■■■ 4.23
GNPTG-209	ENST00000534197	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.49	■■■■■ 4.23
GNPTG-209	ENST00000534197	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
GNPTG-209	ENST00000534197	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.16	■■■■■ 4.18
GNPTG-209	ENST00000534197	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.15	■■■■■ 4.18
GNPTG-209	ENST00000534197	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GNPTG-209	ENST00000534197	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
GNPTG-209	ENST00000534197	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.69	■■■■■ 4.1
GNPTG-209	ENST00000534197	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GNPTG-209	ENST00000534197	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.57	■■■■■ 4.09
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GNPTG-209	ENST00000534197	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
GNPTG-209	ENST00000534197	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
GNPTG-209	ENST00000534197	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
GNPTG-209	ENST00000534197	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.32	■■■■■ 4.04
GNPTG-209	ENST00000534197	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GNPTG-209	ENST00000534197	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GNPTG-209	ENST00000534197	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.24	■■■■■ 4.03
GNPTG-209	ENST00000534197	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.22	■■■■■ 4.03
GNPTG-209	ENST00000534197	CHD1	O14646	1710 aa		40.17	■■■■■ 4.02
GNPTG-209	ENST00000534197	SOGA1	O94964	1423 aa		40.12	■■■■■ 4.01
GNPTG-209	ENST00000534197	CUX1	P39880	1505 aa		40.1	■■■■■ 4.01
GNPTG-209	ENST00000534197	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GNPTG-209	ENST00000534197	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GNPTG-209	ENST00000534197	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4
GNPTG-209	ENST00000534197	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
GNPTG-209	ENST00000534197	FBLN2	P98095	1184 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GNPTG-209	ENST00000534197	WDR97	A6NE52	1622 aa		39.88	■■■■□ 3.97
GNPTG-209	ENST00000534197	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.88	■■■■□ 3.97
GNPTG-209	ENST00000534197	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.78	■■■■□ 3.96
GNPTG-209	ENST00000534197	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.74	■■■■□ 3.95
GNPTG-209	ENST00000534197	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.73	■■■■□ 3.95
GNPTG-209	ENST00000534197	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.72	■■■■□ 3.95
GNPTG-209	ENST00000534197	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.67	■■■■□ 3.94
GNPTG-209	ENST00000534197	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.66	■■■■□ 3.94
GNPTG-209	ENST00000534197	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.66	■■■■□ 3.94
GNPTG-209	ENST00000534197	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.63	■■■■□ 3.94
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.61	■■■■□ 3.93
GNPTG-209	ENST00000534197	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.61	■■■■□ 3.93
GNPTG-209	ENST00000534197	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.59	■■■■□ 3.93
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.58	■■■■□ 3.93
GNPTG-209	ENST00000534197	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.46	■■■■□ 3.91
GNPTG-209	ENST00000534197	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.44	■■■■□ 3.9
GNPTG-209	ENST00000534197	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.42	■■■■□ 3.9	9e-6	■■■■■ 50.1
GNPTG-209	ENST00000534197	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.27	■■■■□ 3.88
GNPTG-209	ENST00000534197	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.26	■■■■□ 3.88
GNPTG-209	ENST00000534197	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.26	■■■■□ 3.88
GNPTG-209	ENST00000534197	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.16	■■■■□ 3.86
GNPTG-209	ENST00000534197	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.14	■■■■□ 3.86
GNPTG-209	ENST00000534197	NUP160	Q12769	1436 aa		39.14	■■■■□ 3.86
GNPTG-209	ENST00000534197	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.11	■■■■□ 3.85
GNPTG-209	ENST00000534197	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.09	■■■■□ 3.85
GNPTG-209	ENST00000534197	SHROOM2	Q13796	1616 aa		38.98	■■■■□ 3.83
GNPTG-209	ENST00000534197	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	38.73	■■■■□ 3.79
GNPTG-209	ENST00000534197	JPH4	Q96JJ6	628 aa		38.72	■■■■□ 3.79
GNPTG-209	ENST00000534197	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		38.72	■■■■□ 3.79
GNPTG-209	ENST00000534197	IGF1R	P08069	1367 aa		38.66	■■■■□ 3.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms