RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462610.1

JOSD1-206, Transcript of Josephin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene JOSD1, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1-206ENST00000462610 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.06■■■■■ 6.73
JOSD1-206ENST00000462610 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.87■■■■■ 5.73
JOSD1-206ENST00000462610 ABCC9O60706 1549 aa49.83■■■■■ 5.57
JOSD1-206ENST00000462610 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
JOSD1-206ENST00000462610 NACADO15069 1562 aa47.9■■■■■ 5.26
JOSD1-206ENST00000462610 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.64■■■■■ 5.22
JOSD1-206ENST00000462610 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.63■■■■■ 5.22
JOSD1-206ENST00000462610 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
JOSD1-206ENST00000462610 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.31■■■■■ 5.16
JOSD1-206ENST00000462610 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.77■■■■■ 5.08
JOSD1-206ENST00000462610 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.51■■■■■ 5.04
JOSD1-206ENST00000462610 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.46■■■■■ 5.03
JOSD1-206ENST00000462610 SCRIBQ14160 1630 aa46.23■■■■■ 4.99
JOSD1-206ENST00000462610 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.14■■■■■ 4.98
JOSD1-206ENST00000462610 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.93■■■■■ 4.94
JOSD1-206ENST00000462610 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
JOSD1-206ENST00000462610 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.12■■■■■ 4.81
JOSD1-206ENST00000462610 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.86■■■■■ 4.77
JOSD1-206ENST00000462610 SMARCA4P51532 1647 aa44.29■■■■■ 4.68
JOSD1-206ENST00000462610 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
JOSD1-206ENST00000462610 NCAPD3P42695 1498 aa44.21■■■■■ 4.67
JOSD1-206ENST00000462610 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.14■■■■■ 4.66
JOSD1-206ENST00000462610 SMARCA2P51531 1590 aa44.11■■■■■ 4.65
JOSD1-206ENST00000462610 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.96■■■■■ 4.63
JOSD1-206ENST00000462610 HMGXB3Q12766 1538 aa43.94■■■■■ 4.63
JOSD1-206ENST00000462610 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.91■■■■■ 4.62
JOSD1-206ENST00000462610 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
JOSD1-206ENST00000462610 WIZO95785 1651 aa43.4■■■■■ 4.54
JOSD1-206ENST00000462610 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
JOSD1-206ENST00000462610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.05■■■■■ 4.48
JOSD1-206ENST00000462610 NESP48681 1621 aa43.04■■■■■ 4.48
JOSD1-206ENST00000462610 ERCC6Q03468 1493 aa43.01■■■■■ 4.48
JOSD1-206ENST00000462610 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
JOSD1-206ENST00000462610 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.88■■■■■ 4.45
JOSD1-206ENST00000462610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.79■■■■■ 4.44
JOSD1-206ENST00000462610 CUX2O14529 1486 aa42.74■■■■■ 4.43
JOSD1-206ENST00000462610 CFTRP13569 1480 aa42.58■■■■■ 4.41
JOSD1-206ENST00000462610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.54■■■■■ 4.4
JOSD1-206ENST00000462610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
JOSD1-206ENST00000462610 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.48■■■■■ 4.39
JOSD1-206ENST00000462610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.33■■■■■ 4.37
JOSD1-206ENST00000462610 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.31■■■■■ 4.36
JOSD1-206ENST00000462610 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.3■■■■■ 4.36
JOSD1-206ENST00000462610 PRDM2Q13029 1718 aa42.2■■■■■ 4.35
JOSD1-206ENST00000462610 WDR62O43379 1518 aa42.18■■■■■ 4.34
JOSD1-206ENST00000462610 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
JOSD1-206ENST00000462610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
JOSD1-206ENST00000462610 ABCC8Q09428 1581 aa41.74■■■■■ 4.27
JOSD1-206ENST00000462610 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.69■■■■■ 4.26
JOSD1-206ENST00000462610 TOPBP1Q92547 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
JOSD1-206ENST00000462610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.59■■■■■ 4.25
JOSD1-206ENST00000462610 IFT140Q96RY7 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
JOSD1-206ENST00000462610 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
JOSD1-206ENST00000462610 CUX1P39880 1505 aa41.21■■■■■ 4.19
JOSD1-206ENST00000462610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
JOSD1-206ENST00000462610 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
JOSD1-206ENST00000462610 SOGA1O94964 1423 aa41.11■■■■■ 4.17
JOSD1-206ENST00000462610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.11■■■■■ 4.17
JOSD1-206ENST00000462610 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
JOSD1-206ENST00000462610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.02■■■■■ 4.16
JOSD1-206ENST00000462610 WDR97A6NE52 1622 aa40.98■■■■■ 4.15
JOSD1-206ENST00000462610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
JOSD1-206ENST00000462610 OSCARQ8IYS5 282 aa40.92■■■■■ 4.14
JOSD1-206ENST00000462610 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
JOSD1-206ENST00000462610 TOP2BQ02880 1626 aa40.85■■■■■ 4.13
JOSD1-206ENST00000462610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
JOSD1-206ENST00000462610 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.84■■■■■ 4.13
JOSD1-206ENST00000462610 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.77■■■■■ 4.12
JOSD1-206ENST00000462610 SYNJ1O43426 1573 aa40.74■■■■■ 4.11
JOSD1-206ENST00000462610 GRIN2BQ13224 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
JOSD1-206ENST00000462610 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.63■■■■■ 4.09
JOSD1-206ENST00000462610 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
JOSD1-206ENST00000462610 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.58■■■■■ 4.09
JOSD1-206ENST00000462610 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.58■■■■■ 4.09
JOSD1-206ENST00000462610 CHD1O14646 1710 aa40.54■■■■■ 4.08
JOSD1-206ENST00000462610 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
JOSD1-206ENST00000462610 FBLN2P98095 1184 aa40.49■■■■■ 4.07
JOSD1-206ENST00000462610 SYNJ2O15056 1496 aa40.44■■■■■ 4.06
JOSD1-206ENST00000462610 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
JOSD1-206ENST00000462610 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.3■■■■■ 4.04
JOSD1-206ENST00000462610 TRIM41Q8WV44 630 aa40.24■■■■■ 4.03
JOSD1-206ENST00000462610 ADAMTS12P58397 1594 aa40.19■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.18■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 ARHGEF11O15085 1522 aa40.18■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.18■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.17■■■■■ 4.02
JOSD1-206ENST00000462610 GRIN2AQ12879 1464 aa40.13■■■■■ 4.01
JOSD1-206ENST00000462610 KIF27Q86VH2 1401 aa40.1■■■■■ 4.01
JOSD1-206ENST00000462610 NUP160Q12769 1436 aa39.99■■■■□ 3.99
JOSD1-206ENST00000462610 IGF1RP08069 1367 aa39.96■■■■□ 3.99
JOSD1-206ENST00000462610 CEP170Q5SW79 1584 aa39.89■■■■□ 3.98
JOSD1-206ENST00000462610 CUL7Q14999 1698 aa39.86■■■■□ 3.97
JOSD1-206ENST00000462610 ARAP1Q96P48 1450 aa39.82■■■■□ 3.97
JOSD1-206ENST00000462610 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.81■■■■□ 3.96
JOSD1-206ENST00000462610 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.71■■■■□ 3.95
JOSD1-206ENST00000462610 SHROOM2Q13796 1616 aa39.69■■■■□ 3.94
JOSD1-206ENST00000462610 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.6■■■■□ 3.93
JOSD1-206ENST00000462610 JPH4Q96JJ6 628 aa39.58■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms