RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527876.5

GNPTG-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 4

Gene GNPTG, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-206ENST00000527876 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.06■■■■■ 6.41
GNPTG-206ENST00000527876 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.4■■■■■ 5.5
GNPTG-206ENST00000527876 ABCC9O60706 1549 aa49.24■■■■■ 5.47
GNPTG-206ENST00000527876 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.92■■■■■ 5.1
GNPTG-206ENST00000527876 NACADO15069 1562 aa46.65■■■■■ 5.06
GNPTG-206ENST00000527876 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.32■■■■■ 5.01
GNPTG-206ENST00000527876 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.18■■■■■ 4.98
GNPTG-206ENST00000527876 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.11■■■■■ 4.97
GNPTG-206ENST00000527876 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.06■■■■■ 4.96
GNPTG-206ENST00000527876 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
GNPTG-206ENST00000527876 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.72■■■■■ 4.91
GNPTG-206ENST00000527876 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
GNPTG-206ENST00000527876 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.53■■■■■ 4.88
GNPTG-206ENST00000527876 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.99■■■■■ 4.79
GNPTG-206ENST00000527876 SCRIBQ14160 1630 aa44.92■■■■■ 4.78
GNPTG-206ENST00000527876 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.57■■■■■ 4.73
GNPTG-206ENST00000527876 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
GNPTG-206ENST00000527876 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.37■■■■■ 4.69
GNPTG-206ENST00000527876 NCAPD3P42695 1498 aa43.12■■■■■ 4.49
GNPTG-206ENST00000527876 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.97■■■■■ 4.47
GNPTG-206ENST00000527876 SMARCA4P51532 1647 aa42.93■■■■■ 4.46
GNPTG-206ENST00000527876 SMARCA2P51531 1590 aa42.78■■■■■ 4.44
GNPTG-206ENST00000527876 HMGXB3Q12766 1538 aa42.77■■■■■ 4.44
GNPTG-206ENST00000527876 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
GNPTG-206ENST00000527876 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
GNPTG-206ENST00000527876 CUX2O14529 1486 aa42.45■■■■■ 4.39
GNPTG-206ENST00000527876 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
GNPTG-206ENST00000527876 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.44■■■■■ 4.39
GNPTG-206ENST00000527876 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.41■■■■■ 4.38
GNPTG-206ENST00000527876 ERCC6Q03468 1493 aa42.41■■■■■ 4.38
GNPTG-206ENST00000527876 NESP48681 1621 aa42.4■■■■■ 4.38
GNPTG-206ENST00000527876 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.09■■■■■ 4.33
GNPTG-206ENST00000527876 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
GNPTG-206ENST00000527876 WIZO95785 1651 aa41.93■■■■■ 4.3
GNPTG-206ENST00000527876 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.87■■■■■ 4.29
GNPTG-206ENST00000527876 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
GNPTG-206ENST00000527876 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.75■■■■■ 4.27
GNPTG-206ENST00000527876 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
GNPTG-206ENST00000527876 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.43■■■■■ 4.22
GNPTG-206ENST00000527876 WDR62O43379 1518 aa41.41■■■■■ 4.22
GNPTG-206ENST00000527876 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
GNPTG-206ENST00000527876 CFTRP13569 1480 aa41.33■■■■■ 4.21
GNPTG-206ENST00000527876 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTG-206ENST00000527876 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTG-206ENST00000527876 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
GNPTG-206ENST00000527876 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
GNPTG-206ENST00000527876 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.91■■■■■ 4.14
GNPTG-206ENST00000527876 TOPBP1Q92547 1522 aa40.51■■■■■ 4.08
GNPTG-206ENST00000527876 OSCARQ8IYS5 282 aa40.46■■■■■ 4.07
GNPTG-206ENST00000527876 IFT140Q96RY7 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
GNPTG-206ENST00000527876 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
GNPTG-206ENST00000527876 TRIM41Q8WV44 630 aa40.37■■■■■ 4.05
GNPTG-206ENST00000527876 ABCC8Q09428 1581 aa40.36■■■■■ 4.05
GNPTG-206ENST00000527876 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.35■■■■■ 4.05
GNPTG-206ENST00000527876 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
GNPTG-206ENST00000527876 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
GNPTG-206ENST00000527876 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
GNPTG-206ENST00000527876 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
GNPTG-206ENST00000527876 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.03■■■■■ 4
GNPTG-206ENST00000527876 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.03■■■■■ 4
GNPTG-206ENST00000527876 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.03■■■■■ 4
GNPTG-206ENST00000527876 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.94■■■■□ 3.98
GNPTG-206ENST00000527876 CHD1O14646 1710 aa39.93■■■■□ 3.98
GNPTG-206ENST00000527876 ARHGEF11O15085 1522 aa39.89■■■■□ 3.98
GNPTG-206ENST00000527876 SOGA1O94964 1423 aa39.86■■■■□ 3.97
GNPTG-206ENST00000527876 CUX1P39880 1505 aa39.86■■■■□ 3.97
GNPTG-206ENST00000527876 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.82■■■■□ 3.97
GNPTG-206ENST00000527876 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
GNPTG-206ENST00000527876 WDR97A6NE52 1622 aa39.75■■■■□ 3.95
GNPTG-206ENST00000527876 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.62■■■■□ 3.93
GNPTG-206ENST00000527876 FBLN2P98095 1184 aa39.59■■■■□ 3.93
GNPTG-206ENST00000527876 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
GNPTG-206ENST00000527876 ARAP1Q96P48 1450 aa39.52■■■■□ 3.92
GNPTG-206ENST00000527876 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
GNPTG-206ENST00000527876 GRIN2BQ13224 1484 aa39.51■■■■□ 3.92
GNPTG-206ENST00000527876 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.5■■■■□ 3.91
GNPTG-206ENST00000527876 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.49■■■■□ 3.91
GNPTG-206ENST00000527876 PBRM1Q86U86 1689 aa39.43■■■■□ 3.9
GNPTG-206ENST00000527876 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.42■■■■□ 3.9
GNPTG-206ENST00000527876 SYNJ2O15056 1496 aa39.4■■■■□ 3.9
GNPTG-206ENST00000527876 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.39■■■■□ 3.9
GNPTG-206ENST00000527876 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.39■■■■□ 3.9
GNPTG-206ENST00000527876 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
GNPTG-206ENST00000527876 SYNJ1O43426 1573 aa39.35■■■■□ 3.89
GNPTG-206ENST00000527876 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.25■■■■□ 3.87
GNPTG-206ENST00000527876 TOP2BQ02880 1626 aa39.23■■■■□ 3.87
GNPTG-206ENST00000527876 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.17■■■■□ 3.869e-6■■■■■ 50.1
GNPTG-206ENST00000527876 ADAMTS12P58397 1594 aa39.04■■■■□ 3.84
GNPTG-206ENST00000527876 GRIN2AQ12879 1464 aa39.03■■■■□ 3.84
GNPTG-206ENST00000527876 NUP160Q12769 1436 aa38.96■■■■□ 3.83
GNPTG-206ENST00000527876 CEP170Q5SW79 1584 aa38.95■■■■□ 3.83
GNPTG-206ENST00000527876 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
GNPTG-206ENST00000527876 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.9■■■■□ 3.82
GNPTG-206ENST00000527876 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.9■■■■□ 3.82
GNPTG-206ENST00000527876 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.89■■■■□ 3.82
GNPTG-206ENST00000527876 SHROOM2Q13796 1616 aa38.83■■■■□ 3.81
GNPTG-206ENST00000527876 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.5■■■■□ 3.75
GNPTG-206ENST00000527876 JPH4Q96JJ6 628 aa38.48■■■■□ 3.75
GNPTG-206ENST00000527876 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
GNPTG-206ENST00000527876 IGF1RP08069 1367 aa38.44■■■■□ 3.74
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