Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C5Q9Y5Q8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF3C5Q9Y5Q8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C5Q9Y5Q8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF3C5Q9Y5Q8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms