Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNB3Q9ULL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNB3Q9ULL4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNB3Q9ULL4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXNB3Q9ULL4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms