Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PGPEP1Q9NXJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms