Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA2

SLC17A5, Sialin, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A5Q9NRA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A5Q9NRA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A5Q9NRA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC17A5Q9NRA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC17A5Q9NRA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC17A5Q9NRA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms