Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACKR4Q9NPB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACKR4Q9NPB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms