Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCB6Q9NP58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCB6Q9NP58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ABCB6Q9NP58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCB6Q9NP58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCB6Q9NP58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCB6Q9NP58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms