Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6CQ9H3T2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA6CQ9H3T2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA6CQ9H3T2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA6CQ9H3T2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA6CQ9H3T2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms