Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ6

NPFFR1, Neuropeptide FF receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR1Q9GZQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPFFR1Q9GZQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPFFR1Q9GZQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPFFR1Q9GZQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms