Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SH2D3AQ9BRG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2D3AQ9BRG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2D3AQ9BRG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SH2D3AQ9BRG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D3AQ9BRG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms