Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR39

JPH2, Junctophilin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH2Q9BR39 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
JPH2Q9BR39 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
JPH2Q9BR39 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
JPH2Q9BR39 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
JPH2Q9BR39 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
JPH2Q9BR39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms