Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD5Q99717 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMAD5Q99717 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMAD5Q99717 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMAD5Q99717 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms