Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRELD1Q96HD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRELD1Q96HD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRELD1Q96HD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRELD1Q96HD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRELD1Q96HD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRELD1Q96HD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRELD1Q96HD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms