Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CSRNP3Q8WYN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CSRNP3Q8WYN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CSRNP3Q8WYN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CSRNP3Q8WYN3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CSRNP3Q8WYN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms