Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDI1Q8WTU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDI1Q8WTU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDI1Q8WTU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDI1Q8WTU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDI1Q8WTU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
DDI1Q8WTU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDI1Q8WTU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDI1Q8WTU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDI1Q8WTU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDI1Q8WTU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms