Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZD8Q8NEN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDZD8Q8NEN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZD8Q8NEN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD8Q8NEN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD8Q8NEN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZD8Q8NEN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD8Q8NEN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms